南京十三中學臺城校區、紅山新城校區面向南京市2024年應屆初三畢業生，招收科技、學科特長生105名，臺城校區招收學科特長生;語文5人、數學10人、物理10人、化學10、生物10人、政治5人、信息學10人。
學習側重點不同。科技、藝術、體育特長生要在學習普通學生的文化課的同時，學習其所特長的方向，而普通學生只需學習文化課部分即可。
分數線不同。中考特長生的文化分較低，專業要求較高。他們不需要按照中考成績錄取，區里會組織統一考試，每個人會給一個分數，然后各學校會下達特長生的錄取分數線，過了分數線就可以錄取。而普通學生有統一分數線，需要按照分數線來錄取。
錄取方式不同。普通生要參加中考文化課考試進入高中，特長生則是根據藝考成績和文化成績進入高中。
此外，特長生和普通生在考試內容、可報考院校數量和可選擇的專業數量方面也存在明顯的區別。
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